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千种植物转录组计划发布新成果

2019-11-04 14:20:00来源:中国食品报
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   《自然》日前发表了中国海洋大学海洋生命学院教授刘涛作为合作作者的国际1KP项目(千种植物转录组计划)成果。作为目前已完成的全球规模最大的基因组研究计划,该项目历时9年,总计完成了1124种植物(包括藻类220种)的测序,1KP项目为人们了解10亿年来的绿色世系植物从水生到陆生,以及不同类群的进化提供了框架和背景知识。

  1KP项目由加拿大阿尔伯塔大学教授Gane Ka-Shu Wong于2008年11月发起,来自130多个国内外单位近200名科学家参与了这项工作。其中,刘涛团队负责41种重要大型海藻转录样本制备和进化分析,中国科学院北京基因组所研究员于军领衔负责转录组数据处理和注释,深圳华大基因科技有限公司负责转录组测序和组装等工作。

  “这项工作也是中国海洋大学深度参与国际大科学计划取得的又一重要成果,为我国经济藻类分子育种技术开发与良种选育打下了坚实的基础。”刘涛说。

  对于“主攻”海带研究的刘涛而言,能完成海带基因组的测序工作让他欣喜不已。如今,刘涛团队采用分子辅助选育技术培育出了“三海”海带新品种,标志着我国海带遗传改良技术已从群体选育、细胞工程育种正式迈入分子育种时代。

  “未来我们可以像现代生活中的商品定制一样,根据养殖户的需求定制培育个性化的海带品种。”刘涛说。

  除了海藻研究,牡蛎和扇贝育种也捷报频传。黝黑发亮的长牡蛎“海大3号”是中国海洋大学水产学院院长李琪团队刚获颁新品种证书不久的“宝贝”。“我们是牡蛎养殖大国,但还不是强国。”李琪表示,这也成了他从事牡蛎新品种培育的动力之源。从我国自主培育的首个牡蛎品种长牡蛎“海大1号”填补了我国牡蛎良种培育的空白开始,李琪团队经过8年攻关,长牡蛎“海大2号”惊艳亮相。

  在相同养殖条件下,与未经选育的长牡蛎相比,“海大2号”平均壳高、体重和出肉率分别提高39.7%、37.9%和25.0%以上,被大家称为牡蛎界的“土豪金”。

  “实际上,在水产育种的道路上,没有最好,只有更好。”中国工程院院士、中国海洋大学海洋生命学院院长包振民说。包振民团队突破了低成本高通量的基因分型技术难关,开发了贝类全基因组选择技术系统,为扇贝品种的更新换代奠定了基础。包振民领衔完成的成果“扇贝分子育种技术创建与新品种培育”获2018年度国家技术发明奖二等奖。

  “我们的目标是建立一个高效率、高水平的扇贝育种技术体系,使扇贝养殖业像农业、畜牧业一样有良种、良法,能高效、平稳、健康地可持续发展。”包振民一直致力于推动海水养殖业走上“绿色道路”。在9月底举行的首届世界海洋科技大会上,包振民表示,“青岛是我国海水养殖技术的发源地,水产养殖业应走绿色发展之路,要做到系统生态化、机械信息化、养殖良种化、产品安全化、市场多元化。水产业本质上是一个绿色、低污染、高产能的产业,在整个动物养殖中水产养殖的效率比畜禽高10倍,因此水产业对于中国农业转型升级也十分重要。”


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